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人工智能進軍基因檢測市場 深度學(xué)習(xí)技術(shù)有助診療基因突變

作者:馮衛(wèi)東
來源:中國科技網(wǎng)-科技日報
日期:2015-07-29 11:16:55
摘要:據(jù)加拿大《環(huán)球郵報》報道,在利用機器學(xué)習(xí)檢測DNA(脫氧核糖核酸)中的致病突變十多年后,加拿大多倫多大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程教授布倫丹·弗雷近日成立了“深基因組學(xué)”公司,準備將其團隊開發(fā)的新技術(shù)推向市場。

人工智能進軍基因檢測市場 深度學(xué)習(xí)技術(shù)有助診療基因突變

  據(jù)加拿大《環(huán)球郵報》報道,在利用機器學(xué)習(xí)檢測DNA(脫氧核糖核酸)中的致病突變十多年后,加拿大多倫多大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程教授布倫丹·弗雷近日成立了“深基因組學(xué)”公司,準備將其團隊開發(fā)的新技術(shù)推向市場。

  弗雷將深基因組學(xué)技術(shù)比喻成基因突變領(lǐng)域的谷歌搜索:研究人員可對一個DNA序列進行查詢,系統(tǒng)將鑒別出突變,并告知這些突變將會導(dǎo)致什么疾病及致病原因。該系統(tǒng)采用的正是人工智能研究的一個分支——深度學(xué)習(xí)技術(shù)。

  目前,基因檢測市場正在以每年翻番的速度蓬勃發(fā)展。麥肯錫公司預(yù)測,2018年基因檢測市場的價值將達到80億美元。雖然深基因組學(xué)公司并不是首家提供突變分析服務(wù)的企業(yè),但弗雷表示,其競爭對手提供的服務(wù)內(nèi)容不夠豐富,他們一次只分析一個核苷酸,尋找一個特定核苷酸和一種疾病之間的關(guān)聯(lián)性,但關(guān)聯(lián)性并不意味著突變一定會引發(fā)疾病。弗雷團隊并不訓(xùn)練其系統(tǒng)來預(yù)測疾病,而是通過測量細胞內(nèi)的內(nèi)容物(如特定蛋白濃度等指標),將細胞系統(tǒng)作為一個整體得出最終結(jié)論。

  弗雷解釋說,他們開發(fā)的系統(tǒng)不是將突變與疾病一一對應(yīng),而是會“學(xué)習(xí)”這種突變所帶來的問題。因為突變在蛋白水平可能會引發(fā)某種疾病,而蛋白水平的降低才能導(dǎo)致這種疾病。這對診斷來說是非常有價值的,如此設(shè)計出的靶向突變的藥物才會真正起效。

  通常的基因組學(xué)診斷程序是:實驗室從患者身上進行DNA采樣,通過連續(xù)測定檢查是否存在與癌癥相關(guān)的典型突變;然后,診斷醫(yī)師會將這些基因突變與已知的實例進行比對;最后,醫(yī)生會根據(jù)上述信息提出療程建議。但有時第二個步驟會失效,因為診斷醫(yī)師可能會遇到一個未知的新突變。這可能會導(dǎo)致并發(fā)癥,并延誤正確的治療。

  而深基因組學(xué)公司的系統(tǒng)可幫助診斷醫(yī)生弄清這些神秘突變,因此治療可得以繼續(xù)。系統(tǒng)允許診斷者更快地生成報告,并給出全新水平的信息來弄清問題的癥結(jié)。

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